Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Thbs2Q03350 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Thbs2Q03350 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms