Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col6a2Q02788 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms