Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NfiaQ02780 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms