Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcd1Q02242 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms