Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VcpQ01853 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VcpQ01853 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VcpQ01853 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms