Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gbp1Q01514 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms