Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EgfrQ01279 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EgfrQ01279 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms