Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde1bQ01065 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde1bQ01065 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms