Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb2Q00977 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms