Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Serpina1cQ00896 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Serpina1cQ00896 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms