Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itga4Q00651 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itga4Q00651 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms