Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GabpaQ00422 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GabpaQ00422 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms