Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stx2Q00262 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms