Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smyd1P97443 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms