Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nbr1P97432 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Nbr1P97432 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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