Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lig3P97386 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig3P97386 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms