Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sec1P97353 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms