Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tp53bp1P70399 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tp53bp1P70399 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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