Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pitx1P70314 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms