Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SbdsP70122 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SbdsP70122 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms