Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsnl1P62761 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms