Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ufm1P61961 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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