Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rin3P59729 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms