Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PtpaP58389 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtpaP58389 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms