Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn18P56857 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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