Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rp1P56716 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rp1P56716 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rp1P56716 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms