Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NcanP55066 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NcanP55066 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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NcanP55066 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NcanP55066 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NcanP55066 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NcanP55066 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms