Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lbx1P52955 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lbx1P52955 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lbx1P52955 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lbx1P52955 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Lbx1P52955 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lbx1P52955 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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