Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SftpdP50404 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms