Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc13P50207 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc13P50207 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms