Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rph3aP47708 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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