Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd4P46935 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd4P46935 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms