Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Syt1P46096 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syt1P46096 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syt1P46096 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms