Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NodalP43021 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NodalP43021 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NodalP43021 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NodalP43021 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NodalP43021 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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