Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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