Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr2P35343 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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