Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab23P35288 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms