Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptpn11P35235 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ptpn11P35235 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms