Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Mmp13P33435 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mmp13P33435 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mmp13P33435 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mmp13P33435 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Mmp13P33435 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Mmp13P33435 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Mmp13P33435 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Mmp13P33435 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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