Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc10P31257 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms