Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RxrgP28705 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RxrgP28705 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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