Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gjb1P28230 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms