Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfraP26618 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms