Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nfkb1P25799 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nfkb1P25799 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms