Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsta3P23591 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsta3P23591 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsta3P23591 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsta3P23591 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsta3P23591 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsta3P23591 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsta3P23591 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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