Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PparaP23204 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PparaP23204 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PparaP23204 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PparaP23204 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms