Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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