Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
PdgfaP20033 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfaP20033 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PdgfaP20033 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfaP20033 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfaP20033 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfaP20033 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PdgfaP20033 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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