Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtpraP18052 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms