Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmga1P17095 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms